木叶孤儿院，这里面收容着很多的战争孤儿，其中有木叶村的战争孤儿，也有火之国的，甚至是木叶根部从砂忍那便收容来的孤儿。
这些孤儿之中，有不少忍者天赋很出众之辈。所以，一般情况下根部的选择人员的时候都喜欢在这里挑选，毕竟这里的孩子没有什么背景，是最好的洗脑人员。
而这些战争孤儿，实际就是木叶每次大战时候的阴影。很多在村外收养回来的孤儿，根本得不到木叶村的信任，将他们放在根部，也算是废物利用了。
不然的话，如果木叶真的将他们培养成为忍，那么信任问题也是一个相当难以明说的东西。
在这其中，和宇智波毅见过面的兜格外的让团藏注意。
团藏并不知道兜有什么特殊的地方，但却本能地想要将其带入根部。为此，团藏不惜以整间孤儿院的维持经费去威胁现在的院长——药师野乃宇。
就如同原著中一样，药师野乃宇为了孤儿院的孩子们，选择了继续为根效力。决定在前往其他国家充当间谍，这项工作很危险……
但最终要的却是，身为间谍的人，终将得不到所有人的信任。
尽管药师野乃宇做出了属于自己的牺牲，但结果依旧没有什么太大的改变。因为各种原因，孤儿院中的其他孩子还是有一部分选择了加入根。
这群孩子有的是因为向往力量，有的是被胁迫，而有的却只是因为想要逃离孤儿院的生活。
总之，这些孩子全部都是自己的选择，无论是威胁也好，利诱也罢。选择加入根部都是他们自己的选择，对于这种选择有些时候，药师野乃宇也无能为力。
她只能够保证孤儿院的大部分孩子生存下去，仅此而已……
……
“宇智波毅，我现在正式邀请你加入根部！”团藏在会议室中，光明正大的开口对着宇智波毅招揽到。
按照团藏的性格，其实不应该这样做。但不知道是不是宇智波毅对着团藏说的那一番话起了什么作用，团藏居然在木叶各个家族开会，猿飞日斩准备辞去火影之位之时，对着宇智波毅开口说道。
“根部？就是那个进入之后丧失人性，身施加必死禁制，生死全在你团藏大人一手掌控的组织吗？”宇智波毅听了团藏的话，眼神之中闪过一丝淡淡的讥讽。
在座的其他家族负责人和精英忍们听了宇智波毅的话，脸闪过了一丝好笑，又非常复杂的心情。
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